Công viên có khoảng 8.800 cây, bao gồm bạch quả, long não, Zelkova serrata, anh đào hoa chuông, anh đào Yoshino và anh đào Nhật Bản. Có thêm 24.800 m2 cây bụi.[1] Shinobazu Pond là một hồ nước nhỏ với diện tích 16 ha, đầy sen hồng và đầm lầy xung quanh. Nó là địa điểm trú đông quan trọng cho các loài chim. Các loài thường được tìm thấy bao gồm vịt búi lông, vịt đầu vàng, vịt mốc, vịt đầu đỏ, le hôi, diệc lớn, cốc đế. Ngoài ra còn có vịt đầu đen, vịt khoang cổ, vịt trời Mỹ.[12]

Hòn đảo trung tâm có đền thờ Benzaiten, vị nữ thần tài lộc, đền nằm trên đảo Chikubu ở giữa hồ Biwa.[13] Khu vực này từng có đầy những "quán trà điểm hẹn", gần giống với khách sạn tình yêu hiện nay.[13] Sau chiến tranh Thái Bình Dương, hồ được rút cạn và được sử dụng để trồng ngũ cốc và sau đó có kế hoạch biến địa điểm này thành sân vận động bóng chày hoặc bãi đậu xe nhiều tầng.[14] Sen hồng trong hồ đã được phục hồi vào năm 1949, mặc dù người ta lại vô ý để ráo nước vào năm 1968 khi xây dựng đường tàu điện ngầm mới.[14]

Trong công viên có tất cả khoảng tám trăm cây anh đào, nếu tính những cây thuộc đền thờ Ueno Tōshō-gū, các công trình đền thờ, và các điểm lân cận khác, tổng số lên tới một nghìn hai trăm.[11] Lấy cảm hứng từ đây, Matsuo Bashō đã viết "đám mây hoa - là tiếng chuông chùa từ Ueno hoặc Asakusa".[15]